映画「ゼブラーマンーゼブラシティの逆襲ー」に伴い５年振りに宮藤官九郎×山田
玲司の大ヒットコミックス「ゼブラーマン」も堂々復活!!　
　かつて愛する街を集団テロ組織・銀河教会から救ったヒーローおたくのダメ教師・市川新市は、一時的に本物のヒーローとなった。
　しかし、街の治安は再び悪化し、犯罪者によって妻と娘、さらには初恋の人まで失うことに………
　失意の新市は、街から姿を消した。
　１０年後、街はゼブラシティとなり、怪しい者は容赦なく逮捕されるゼブラタイムが実施されていた。
　人生に白黒つけるゼブラーマンの戦いは、思いもよらぬ結末へ…!!